Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn1r81-203ENSMUST00000227973 14002 ntAPPRIS P2 BASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Sult2a1-201ENSMUST00000108522 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11923-201ENSMUST00000118135 508 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15926-201ENSMUST00000120492 550 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Spin2-ps4-201ENSMUST00000126395 762 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 9130015L21Rik-201ENSMUST00000140319 606 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Spin2-ps3-201ENSMUST00000148147 762 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm22531-201ENSMUST00000158819 140 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn2r-ps36-201ENSMUST00000172589 2562 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Rhoay-ps3-201ENSMUST00000187648 576 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17777-201ENSMUST00000189740 1276 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Rhoay-ps1-201ENSMUST00000191243 581 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13266-203ENSMUST00000193364 421 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7041-201ENSMUST00000201227 524 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43155-201ENSMUST00000202661 494 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15927-204ENSMUST00000206075 372 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44887-201ENSMUST00000208980 178 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45539-201ENSMUST00000210313 428 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Mir670hg-207ENSMUST00000211619 819 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm31717-201ENSMUST00000213044 668 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1116-202ENSMUST00000216364 9655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 AC153852.1-201ENSMUST00000217881 567 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3829-201ENSMUST00000222362 619 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 AC140344.1-201ENSMUST00000223384 387 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 CT030705.1-201ENSMUST00000223971 533 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 AC102815.1-201ENSMUST00000226662 1061 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 AC155167.1-201ENSMUST00000228931 614 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr603-201ENSMUST00000071844 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26072-201ENSMUST00000083135 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr125-202ENSMUST00000213857 3835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 F8-201ENSMUST00000033539 9784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1484-204ENSMUST00000216014 3842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr44-202ENSMUST00000215065 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 C87414-206ENSMUST00000162964 2852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn2r91-201ENSMUST00000172359 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Trav15-1-dv6-1-201ENSMUST00000103653 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6760-201ENSMUST00000114682 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm22676-201ENSMUST00000116972 129 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11372-201ENSMUST00000117348 570 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13314-201ENSMUST00000118742 335 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp4b1-ps2-201ENSMUST00000119563 333 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm22988-201ENSMUST00000122759 144 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11195-201ENSMUST00000135030 441 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Ighv1-77-201ENSMUST00000170551 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2617-201ENSMUST00000185690 1066 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29380-201ENSMUST00000185898 416 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29408-201ENSMUST00000187536 216 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37343-201ENSMUST00000192542 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37001-201ENSMUST00000193377 190 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm567-201ENSMUST00000197127 469 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42470-201ENSMUST00000198086 251 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr663-201ENSMUST00000209914 959 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 AC125379.1-201ENSMUST00000221928 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 CT010506.3-201ENSMUST00000223699 410 ntBASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr112-201ENSMUST00000085548 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Xiap-201ENSMUST00000026978 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Oog2-201ENSMUST00000080405 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Skint3-202ENSMUST00000170945 3843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrtm2-201ENSMUST00000091636 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 2410141K09Rik-202ENSMUST00000172579 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14696-201ENSMUST00000144294 3976 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn1r45-205ENSMUST00000227571 2757 ntBASIC2.53□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Lyst-201ENSMUST00000110559 13181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Npy6r-201ENSMUST00000042747 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Igkv1-131-201ENSMUST00000103306 362 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm23697-201ENSMUST00000103897 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26418-201ENSMUST00000104275 137 ntBASIC2.53□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr596-201ENSMUST00000104880 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15263-201ENSMUST00000121556 642 ntBASIC2.53□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm22480-201ENSMUST00000122568 128 ntBASIC2.53□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26276-201ENSMUST00000157099 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25427-201ENSMUST00000157605 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn1r163-201ENSMUST00000164537 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn1r128-201ENSMUST00000169165 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms