Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm2892-201ENSMUST00000145537 711 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Nell1os-203ENSMUST00000152166 410 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm16236-201ENSMUST00000159588 379 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Spin2e-201ENSMUST00000179716 705 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm28889-201ENSMUST00000185350 959 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm4035-202ENSMUST00000190684 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 AC132384.5-201ENSMUST00000218562 226 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm9616-201ENSMUST00000221154 781 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 AC154241.1-201ENSMUST00000223952 356 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 AC174459.2-201ENSMUST00000226036 160 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 AC074315.1-201ENSMUST00000228801 214 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 BC048502-201ENSMUST00000065978 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Vmn1r48-201ENSMUST00000073415 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 n-R5s7-201ENSMUST00000083755 121 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm26996-201ENSMUST00000204418 1359 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 5930435M05Rik-201ENSMUST00000207572 3712 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Vmn1r169-202ENSMUST00000226669 2326 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Chl1-201ENSMUST00000066905 7562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Vmn2r51-201ENSMUST00000094863 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Vmn1r43-205ENSMUST00000228709 12646 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 B930086L07Rik-201ENSMUST00000209529 3738 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm22758-201ENSMUST00000102275 96 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm26367-201ENSMUST00000104165 132 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm14037-201ENSMUST00000120576 313 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm5391-201ENSMUST00000121155 613 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm14784-201ENSMUST00000121604 663 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm11506-201ENSMUST00000122414 470 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm13194-201ENSMUST00000142299 311 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm19807-201ENSMUST00000173971 667 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm27896-201ENSMUST00000175162 317 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm15143-201ENSMUST00000178180 714 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Mir6907-201ENSMUST00000183764 71 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm7897-201ENSMUST00000193981 554 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm45458-201ENSMUST00000209900 522 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 1700054O05Rik-201ENSMUST00000214107 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm19987-201ENSMUST00000216339 499 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr91-202ENSMUST00000216376 3832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 AC153526.4-201ENSMUST00000217713 379 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 AC160931.2-201ENSMUST00000221445 351 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Sult6b1-201ENSMUST00000042683 839 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Glra3-201ENSMUST00000000275 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 AC154329.1-201ENSMUST00000224408 3129 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Pkhd1l1-203ENSMUST00000209244 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm20515-201ENSMUST00000174440 4824 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm28362-201ENSMUST00000189430 2420 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr1309-206ENSMUST00000217452 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Vmn1r216-203ENSMUST00000228389 10213 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Vmn1r14-204ENSMUST00000227768 7005 ntAPPRIS P2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gabra6-202ENSMUST00000109286 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Dach2-202ENSMUST00000113378 2089 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm10552-201ENSMUST00000113396 372 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm14050-201ENSMUST00000117052 346 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm12062-201ENSMUST00000117533 259 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm7648-201ENSMUST00000173036 1658 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Nutf2-ps2-201ENSMUST00000179225 384 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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