Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm28141-201ENSMUST00000186676 342 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm38050-201ENSMUST00000191904 238 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm8953-201ENSMUST00000198497 904 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm43941-201ENSMUST00000203303 1073 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Arl2bp-203ENSMUST00000211858 318 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm16368-201ENSMUST00000222340 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm17275-201ENSMUST00000181811 2550 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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ptchd1Q14B62 AC122448.1-201ENSMUST00000226317 772 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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ptchd1Q14B62 Olfr857-201ENSMUST00000077023 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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ptchd1Q14B62 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms