Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm11692-201ENSMUST00000122121 902 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm22613-201ENSMUST00000122679 292 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Tarbp2-207ENSMUST00000142114 420 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 4930505K14Rik-201ENSMUST00000155504 515 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm24773-201ENSMUST00000158513 99 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm24220-201ENSMUST00000177753 79 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm25988-201ENSMUST00000177759 79 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm23471-201ENSMUST00000177886 79 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm26488-201ENSMUST00000178225 79 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm23449-201ENSMUST00000179208 79 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm25221-201ENSMUST00000180051 79 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm2617-201ENSMUST00000185690 1066 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 1700101O22Rik-201ENSMUST00000187396 339 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 1700024B18Rik-201ENSMUST00000190088 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Olfr1295-202ENSMUST00000207786 1043 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Fth-ps3-201ENSMUST00000210405 358 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm17829-201ENSMUST00000219782 344 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 AC154368.1-201ENSMUST00000223465 205 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Mir34b-201ENSMUST00000083558 84 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm37363-201ENSMUST00000192336 2233 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Ktn1-201ENSMUST00000022391 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm4788-201ENSMUST00000027612 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 AC173482.1-201ENSMUST00000224494 3815 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 AC123705.2-201ENSMUST00000221653 2009 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Olfr1307-201ENSMUST00000099604 15582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Dnah3-201ENSMUST00000046993 12252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm20515-201ENSMUST00000174440 4824 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Olfr1093-203ENSMUST00000219561 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm8475-201ENSMUST00000118211 526 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm13831-201ENSMUST00000118764 302 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm13470-201ENSMUST00000123911 421 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm23231-201ENSMUST00000157299 104 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Mir1251-201ENSMUST00000175486 84 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Scgb2b9-ps-201ENSMUST00000189522 334 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm28822-201ENSMUST00000191140 778 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm43604-201ENSMUST00000199799 705 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm32772-201ENSMUST00000205898 594 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm44852-201ENSMUST00000207950 369 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 AC162934.1-201ENSMUST00000222880 309 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Btbd35f23-201ENSMUST00000189190 1943 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 P2ry14-205ENSMUST00000197220 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 AC167420.1-201ENSMUST00000222999 2121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Olfr843-202ENSMUST00000214019 7499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm37625-201ENSMUST00000194969 4872 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm14325-201ENSMUST00000108939 1576 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm43508-201ENSMUST00000197251 3783 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Tenm1-202ENSMUST00000115058 12837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Igkv3-7-201ENSMUST00000103399 299 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm23481-201ENSMUST00000104173 131 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm13677-201ENSMUST00000120739 595 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm25369-201ENSMUST00000158848 132 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm7241-201ENSMUST00000159853 357 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm6625-201ENSMUST00000177870 272 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm29380-201ENSMUST00000185898 416 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm38069-201ENSMUST00000195360 2144 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm43645-201ENSMUST00000200129 341 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm7468-201ENSMUST00000203900 652 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm45031-201ENSMUST00000206800 288 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms