Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm24100-201ENSMUST00000178592 79 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm24137-201ENSMUST00000180055 79 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm22391-201ENSMUST00000180356 79 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 A530053G22Rik-201ENSMUST00000060147 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm28634-201ENSMUST00000191087 2613 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Trim30b-205ENSMUST00000171830 2771 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm15773-201ENSMUST00000118665 1448 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Apool-202ENSMUST00000113415 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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VdrP48281 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm14008-201ENSMUST00000120483 274 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 2610024D14Rik-201ENSMUST00000121233 294 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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VdrP48281 4930587E11Rik-202ENSMUST00000204857 807 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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VdrP48281 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Ube2v2-201ENSMUST00000096234 609 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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VdrP48281 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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