Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm35558-203ENSMUST00000222264 204 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm16368-201ENSMUST00000222340 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 AC116557.1-201ENSMUST00000219494 1521 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Spocd1B1ASB6 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm4487-201ENSMUST00000150617 442 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm17916-202ENSMUST00000187634 1187 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm42814-201ENSMUST00000199370 460 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gpx8-201ENSMUST00000022282 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm23988-201ENSMUST00000117034 122 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm14835-201ENSMUST00000119039 315 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm23499-201ENSMUST00000157736 268 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm21726-201ENSMUST00000179654 392 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm27190-201ENSMUST00000184890 542 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Olfr1482-ps1-201ENSMUST00000207181 178 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 AC069561.3-201ENSMUST00000217321 114 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Spocd1B1ASB6 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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