Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm15994-201ENSMUST00000118029 402 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm14408-202ENSMUST00000126726 279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm6075-201ENSMUST00000186816 486 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm19726-201ENSMUST00000205008 240 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm44779-201ENSMUST00000206937 708 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm35548-201ENSMUST00000214348 441 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm2645-201ENSMUST00000223516 547 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm43428-201ENSMUST00000200108 3845 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Olfr19-202ENSMUST00000206365 1967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Olfr1261-204ENSMUST00000216953 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm6584-201ENSMUST00000119671 447 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Mir3964-201ENSMUST00000174898 74 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm10038-201ENSMUST00000077233 441 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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