Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm11830-201ENSMUST00000120175 561 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 AC158641.1-201ENSMUST00000218933 229 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 AC153977.1-201ENSMUST00000219416 506 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 CT573086.3-201ENSMUST00000228762 594 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r17-201ENSMUST00000171841 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm26733-201ENSMUST00000180846 2046 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm14919-201ENSMUST00000120839 390 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm22345-201ENSMUST00000122644 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Spcs2-205ENSMUST00000207580 868 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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