Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Mcmdc2-203ENSMUST00000125294 2003 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr799-202ENSMUST00000213820 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11409-201ENSMUST00000118621 403 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10038-201ENSMUST00000077233 441 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24150-201ENSMUST00000082759 104 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr720-203ENSMUST00000216079 4692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r169-202ENSMUST00000226669 2326 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr13-202ENSMUST00000216179 3677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 AI847159-204ENSMUST00000148997 753 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26177-201ENSMUST00000178683 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 AC127371.1-201ENSMUST00000228516 312 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44625-201ENSMUST00000207838 1561 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 2310001H17Rik-203ENSMUST00000181517 3981 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7195-201ENSMUST00000190869 1707 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms