Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm14473-201ENSMUST00000122269 557 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm11958-201ENSMUST00000127224 253 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm14161-201ENSMUST00000137020 339 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm16250-201ENSMUST00000148974 256 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Ubl5-209ENSMUST00000161882 489 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm17177-201ENSMUST00000169144 483 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm22395-201ENSMUST00000177427 96 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps16-201ENSMUST00000178737 377 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps15-201ENSMUST00000180112 377 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm42814-201ENSMUST00000199370 460 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm17887-201ENSMUST00000200194 547 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm32443-202ENSMUST00000220011 773 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Olfr134-201ENSMUST00000074883 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Phex-201ENSMUST00000079945 6265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Olfr1249-202ENSMUST00000216124 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Dach2-202ENSMUST00000113378 2089 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Zfp981-201ENSMUST00000105735 3038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Olfr616-203ENSMUST00000217293 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Olfr1251-202ENSMUST00000214639 3071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Lrp1b-201ENSMUST00000052550 16294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm25965-201ENSMUST00000157170 93 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm23554-201ENSMUST00000157818 110 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm25520-201ENSMUST00000158389 118 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Ap3m1-ps-201ENSMUST00000177652 1258 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Rian-214ENSMUST00000183026 596 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm28304-201ENSMUST00000185977 312 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Arl2bp-203ENSMUST00000211858 318 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Resp18-201ENSMUST00000039534 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm7173-201ENSMUST00000101410 2832 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Txndc9-204ENSMUST00000193832 3472 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm8995-201ENSMUST00000184842 7280 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 AC155922.2-201ENSMUST00000220240 1458 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Vmn1r185-207ENSMUST00000227695 5292 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Olfr353-203ENSMUST00000217215 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 AC142245.1-201ENSMUST00000226611 1505 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm14308-201ENSMUST00000108990 1628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Vmn1r81-205ENSMUST00000228764 13763 ntAPPRIS P2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 AC132336.1-201ENSMUST00000222844 1740 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Zfp131-201ENSMUST00000177916 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Olfr301-201ENSMUST00000174362 1937 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 AC153522.2-201ENSMUST00000218389 3853 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Zfp708-201ENSMUST00000109742 2416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm24318-201ENSMUST00000104490 131 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm15517-201ENSMUST00000124863 251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm23702-201ENSMUST00000158840 130 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Mir6960-201ENSMUST00000183449 61 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm27695-201ENSMUST00000184301 91 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm42451-201ENSMUST00000197410 244 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Olfr964-ps1-201ENSMUST00000217577 914 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 AC122465.3-201ENSMUST00000221644 355 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 CT030166.1-201ENSMUST00000222654 357 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm18441-201ENSMUST00000223539 617 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 AC117949.2-201ENSMUST00000225900 584 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Diaph3-206ENSMUST00000226745 713 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Vmn1r26-201ENSMUST00000049694 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Olfr857-201ENSMUST00000077023 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Olfr665-203ENSMUST00000216257 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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