Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm3616-201ENSMUST00000174430 2514 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm3683-201ENSMUST00000175701 2513 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Tc2n-202ENSMUST00000160715 1386 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm40020-201ENSMUST00000215677 1635 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 AC154640.4-201ENSMUST00000226647 4640 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm5935-201ENSMUST00000101667 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm13064-201ENSMUST00000119125 557 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 2610024D14Rik-201ENSMUST00000121233 294 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 AL672194.1-201ENSMUST00000224841 603 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm24148-201ENSMUST00000082762 80 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm22628-201ENSMUST00000082988 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Olfr713-201ENSMUST00000098139 975 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Olfr1218-201ENSMUST00000099798 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Xlr5a-202ENSMUST00000114520 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm14365-201ENSMUST00000117535 587 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4dQ8BGV9 Mir1264-201ENSMUST00000175381 86 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms