Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm1979-202ENSMUST00000170224 666 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Gm23287-201ENSMUST00000179427 116 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Gm23143-201ENSMUST00000180137 116 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Cox6b2-206ENSMUST00000182738 423 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Gm27864-201ENSMUST00000183704 190 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Gm29031-201ENSMUST00000185316 614 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Gm29000-201ENSMUST00000185444 614 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Gm28204-201ENSMUST00000185934 614 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Gm28290-201ENSMUST00000186505 614 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Gm28161-201ENSMUST00000186669 614 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Gm28749-209ENSMUST00000189599 614 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Gm33163-201ENSMUST00000194504 614 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Gm17967-201ENSMUST00000195319 647 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 5430402P08Rik-201ENSMUST00000211799 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 BC048502-201ENSMUST00000065978 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Olfr344-201ENSMUST00000075474 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Olfr1465-201ENSMUST00000080142 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Gm24871-201ENSMUST00000083099 116 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Rnu5g-201ENSMUST00000093721 116 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Kif20b-201ENSMUST00000087341 5564 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Olfr112-204ENSMUST00000208832 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Zfp101-204ENSMUST00000174512 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Gm10256-201ENSMUST00000179404 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 AC156025.1-201ENSMUST00000223597 3551 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Actn1Q7TPR4 Olfr588-ps1-201ENSMUST00000118682 4607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Rps6ka3-204ENSMUST00000112493 3671 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Plcb4-201ENSMUST00000035646 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Olfr187-202ENSMUST00000207673 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Vmn1r72-203ENSMUST00000227010 6279 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Gm12311-201ENSMUST00000118803 374 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Gm12719-201ENSMUST00000118859 241 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Gm44354-201ENSMUST00000196017 143 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Gm44300-201ENSMUST00000196792 121 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Gm26691-203ENSMUST00000200444 479 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 AC156504.1-201ENSMUST00000214608 157 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 AC130536.1-201ENSMUST00000224425 271 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Olfr847-201ENSMUST00000079620 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 mt-Nd4l-201ENSMUST00000084013 297 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Olfr1318-205ENSMUST00000217533 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Vmn1r185-212ENSMUST00000228633 5385 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Olfr128-202ENSMUST00000216440 3644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Tenm1-203ENSMUST00000115059 12879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Vmn2r93-201ENSMUST00000079206 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Gm14014-201ENSMUST00000156718 2717 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Gm9921-201ENSMUST00000173293 4399 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 9330159F19Rik-202ENSMUST00000213489 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Gm15426-201ENSMUST00000117823 556 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 2210408F21Rik-206ENSMUST00000138653 417 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Gm13905-201ENSMUST00000140009 579 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Gm15344-201ENSMUST00000152600 421 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Gm23179-201ENSMUST00000158693 304 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Olfr1225-201ENSMUST00000188861 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Gm18303-201ENSMUST00000190055 1176 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Gm38201-201ENSMUST00000192143 387 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Mir129b-201ENSMUST00000197461 65 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Gm45710-201ENSMUST00000212847 215 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Actn1Q7TPR4 AC079644.1-201ENSMUST00000220586 405 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms