Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 AC162376.1-201ENSMUST00000220120 435 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 LOC667541-201ENSMUST00000223408 278 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r72-201ENSMUST00000053134 921 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm23443-201ENSMUST00000082916 128 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Olfr263-202ENSMUST00000215804 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1028-201ENSMUST00000080698 3474 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm13852-201ENSMUST00000122350 242 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm11534-201ENSMUST00000125956 204 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm6058-201ENSMUST00000154261 399 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm22890-201ENSMUST00000158642 144 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 1700040K01Rik-201ENSMUST00000195145 438 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm38991-201ENSMUST00000205504 138 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm18644-201ENSMUST00000211458 815 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 AC166343.1-201ENSMUST00000213261 577 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 AC159263.3-201ENSMUST00000223434 460 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 AC154467.1-201ENSMUST00000227527 449 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 AI504432-201ENSMUST00000070085 5569 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Mgat4c-212ENSMUST00000179929 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb41-201ENSMUST00000039867 8361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm14387-201ENSMUST00000121827 2055 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm10256-201ENSMUST00000179404 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm37792-201ENSMUST00000195761 3413 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Igkv1-135-201ENSMUST00000103303 394 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm14559-201ENSMUST00000121745 496 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm12858-201ENSMUST00000121913 208 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm15796-201ENSMUST00000162135 204 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Mir5127-201ENSMUST00000175295 71 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm6625-201ENSMUST00000177870 272 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm4859-201ENSMUST00000199625 787 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm45839-201ENSMUST00000209884 399 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm45651-201ENSMUST00000210857 335 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 CT030247.1-201ENSMUST00000216810 267 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 AC158686.2-201ENSMUST00000218599 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Olfr790-204ENSMUST00000218901 1070 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Olfr790-201ENSMUST00000056002 1070 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Elavl2-208ENSMUST00000107120 4191 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Sft2d1Q5SSN7 Olfr836-202ENSMUST00000212730 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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