Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Gm31693-201ENSMUST00000200150 909 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Olfr480-201ENSMUST00000071658 1029 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Olfr138-201ENSMUST00000071871 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Gm24490-201ENSMUST00000083803 98 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Gm28047Q3US59 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Gm44164-201ENSMUST00000203605 2561 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Gm28047Q3US59 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Gm28047Q3US59 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Gm28047Q3US59 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Gm28047Q3US59 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Gm28047Q3US59 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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Gm28047Q3US59 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm28047Q3US59 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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