Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm23158-201ENSMUST00000175076 126 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm22907-201ENSMUST00000175198 126 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm22625-201ENSMUST00000175382 126 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm22875-201ENSMUST00000175449 126 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm25197-201ENSMUST00000175516 126 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm27857-201ENSMUST00000176930 126 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm26268-201ENSMUST00000177685 126 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm23681-201ENSMUST00000178821 126 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm42830-201ENSMUST00000196642 313 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm36382-201ENSMUST00000198892 541 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr1492-ps1-201ENSMUST00000207071 865 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Calml4-203ENSMUST00000213643 710 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm39302-201ENSMUST00000215184 636 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm7093-201ENSMUST00000223004 581 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Fam135a-206ENSMUST00000187369 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Abca16-201ENSMUST00000056042 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Cntn6-201ENSMUST00000089215 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 AC144772.3-201ENSMUST00000228829 3126 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr887-202ENSMUST00000212502 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Dnah7a-201ENSMUST00000094964 12245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Klhl13-204ENSMUST00000115317 3216 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr203-202ENSMUST00000215893 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr951-202ENSMUST00000216107 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr19-202ENSMUST00000206365 1967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr843-202ENSMUST00000214019 7499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm23481-201ENSMUST00000104173 131 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Fbxl13-202ENSMUST00000115234 2143 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Sult1b1-203ENSMUST00000120150 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Tpt1-ps3-201ENSMUST00000121046 519 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm23789-201ENSMUST00000122536 301 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm15767-202ENSMUST00000153786 544 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm13985-201ENSMUST00000154409 621 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm25264-201ENSMUST00000158519 117 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm3123-201ENSMUST00000163480 480 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm5258-201ENSMUST00000165437 327 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Defa27-202ENSMUST00000168340 371 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm27942-201ENSMUST00000184669 101 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm4854-201ENSMUST00000185902 574 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm38149-201ENSMUST00000191943 339 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm45434-201ENSMUST00000210550 293 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 AC165283.1-201ENSMUST00000223390 307 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 4930455B14Rik-204ENSMUST00000224776 848 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr1022-201ENSMUST00000054736 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Stfa2l1-201ENSMUST00000079184 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Mir215-201ENSMUST00000083628 112 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Mir504-201ENSMUST00000093602 79 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm15304-201ENSMUST00000122150 2640 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Cdh7-209ENSMUST00000172005 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr709-ps1-202ENSMUST00000215468 5078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm38152-201ENSMUST00000195389 3566 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Neb-202ENSMUST00000036934 22489 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Vmn2r31-201ENSMUST00000075108 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr1355-201ENSMUST00000078414 3317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Nebl-206ENSMUST00000131957 1709 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Elavl4-205ENSMUST00000106600 3799 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm15382-201ENSMUST00000118011 537 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm14771-201ENSMUST00000118249 203 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Trim71Q1PSW8 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
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