Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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ptchd1Q14B62 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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ptchd1Q14B62 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm29213-202ENSMUST00000189703 484 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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ptchd1Q14B62 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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ptchd1Q14B62 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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ptchd1Q14B62 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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ptchd1Q14B62 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm43443-201ENSMUST00000202337 2393 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Aadacl2-201ENSMUST00000169794 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AC134596.1-201ENSMUST00000222016 1922 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm24550-201ENSMUST00000158648 279 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms