Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm42728-201ENSMUST00000202644 1552 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm23594-201ENSMUST00000104307 134 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm11843-201ENSMUST00000118984 425 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm23212-201ENSMUST00000122718 60 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm37340-201ENSMUST00000193124 759 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm6051-201ENSMUST00000201529 352 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm32772-201ENSMUST00000205898 594 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm45236-201ENSMUST00000208632 229 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm19096-201ENSMUST00000209705 766 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Olfr946-ps1-201ENSMUST00000217547 341 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 4930563J15Rik-203ENSMUST00000219796 574 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 4930448F12Rik-201ENSMUST00000220795 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Olfr881-201ENSMUST00000074611 948 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Olfr677-201ENSMUST00000098161 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Olfr1290-204ENSMUST00000217611 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Xlr5d-ps-201ENSMUST00000117501 782 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm25278-201ENSMUST00000157267 120 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm25923-201ENSMUST00000158312 138 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Siah1bQ06985 Gm16114-201ENSMUST00000161930 300 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.6 ms