Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm15143-201ENSMUST00000178180 714 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Mir6410-201ENSMUST00000184204 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Mir6398-201ENSMUST00000184541 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm43476-201ENSMUST00000197873 405 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm32780-201ENSMUST00000201402 540 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Tgif1-ps-201ENSMUST00000201864 736 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm38991-201ENSMUST00000205504 138 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 AC131747.1-201ENSMUST00000226159 793 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm6863-201ENSMUST00000052882 636 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Art2b-201ENSMUST00000063920 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 BC048502-201ENSMUST00000065978 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Olfr294-201ENSMUST00000078588 1008 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Mir34b-201ENSMUST00000083558 84 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm5724-201ENSMUST00000148411 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Tfpi-202ENSMUST00000090732 3576 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Nlrp4b-202ENSMUST00000117413 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 2210418O10Rik-203ENSMUST00000136719 2314 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm7470-201ENSMUST00000194219 2095 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Vmn1r45-205ENSMUST00000227571 2757 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Vmn2r-ps49-201ENSMUST00000173160 3551 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Kctd4-201ENSMUST00000050120 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Postn-203ENSMUST00000107985 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Olfr836-202ENSMUST00000212730 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Tc2n-202ENSMUST00000160715 1386 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Olfr1458-202ENSMUST00000215160 1914 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Olfr1326-ps1-201ENSMUST00000059880 3637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm23697-201ENSMUST00000103897 110 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm23319-201ENSMUST00000104467 131 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm11408-201ENSMUST00000117889 519 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Hmgb1-ps5-201ENSMUST00000121058 557 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm4912-201ENSMUST00000122212 1044 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm12226-201ENSMUST00000144172 876 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm26320-201ENSMUST00000157742 306 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm26001-201ENSMUST00000157989 103 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Vmn1r163-201ENSMUST00000164537 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Vmn1r135-201ENSMUST00000170931 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Vmn1r143-201ENSMUST00000171622 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Vmn1r-ps71-201ENSMUST00000172648 924 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm22646-201ENSMUST00000175130 115 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm13249-201ENSMUST00000177803 345 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm14419-204ENSMUST00000178182 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm2004-202ENSMUST00000178872 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm13144-201ENSMUST00000179385 345 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm14295-203ENSMUST00000179435 192 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Vmn2r-ps149-201ENSMUST00000188423 590 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm28997-201ENSMUST00000188759 429 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm37836-201ENSMUST00000195875 175 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm43601-201ENSMUST00000196294 945 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm22897-201ENSMUST00000197860 128 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm43001-202ENSMUST00000199076 192 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Hcfc1r1-ps2-201ENSMUST00000199379 339 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm4859-201ENSMUST00000199625 787 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm17887-201ENSMUST00000200194 547 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm10445-201ENSMUST00000203521 762 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 2200007N16Rik-201ENSMUST00000206367 238 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 4930563J15Rik-203ENSMUST00000219796 574 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Ifngas1-201ENSMUST00000220034 1121 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 AC127270.2-201ENSMUST00000221337 247 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm46998-201ENSMUST00000221444 330 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 AC133517.1-202ENSMUST00000224409 233 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 AC166095.1-203ENSMUST00000224591 233 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Mir383-201ENSMUST00000083523 70 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Zfp518a-201ENSMUST00000050092 6840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Olfr1058-202ENSMUST00000213998 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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