Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Themis-202ENSMUST00000060409 2278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Olfr652-203ENSMUST00000216131 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Cbll1-204ENSMUST00000185739 3945 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Trav12d-2-201ENSMUST00000103593 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Trav12n-2-201ENSMUST00000103619 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Gm6760-201ENSMUST00000114682 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Psmb7-ps2-201ENSMUST00000118546 820 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Gm28148-201ENSMUST00000186924 697 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Gm25630-201ENSMUST00000084000 162 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Vmn1r34-205ENSMUST00000227332 3075 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Gm14014-201ENSMUST00000156718 2717 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Olfr1012-202ENSMUST00000214255 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Gm7308-201ENSMUST00000121087 447 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Gm32391-201ENSMUST00000191839 540 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprkP35822 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprkP35822 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Kctd12b-201ENSMUST00000039424 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Vmn1r89-208ENSMUST00000228587 2061 ntAPPRIS P2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Txndc9-204ENSMUST00000193832 3472 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Ighv3-5-201ENSMUST00000103479 299 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.44
PtprkP35822 P2ry10-202ENSMUST00000118666 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Gm3835-201ENSMUST00000120752 403 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Gm12358-201ENSMUST00000121842 520 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Gm15949-201ENSMUST00000129485 126 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Mir3058-201ENSMUST00000175126 91 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Gm26556-201ENSMUST00000180645 320 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Trbv8-201ENSMUST00000194020 285 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Gm43825-201ENSMUST00000199650 734 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
PtprkP35822 AC121542.1-201ENSMUST00000227245 721 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.44
PtprkP35822 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm16005-201ENSMUST00000120515 269 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm24949-201ENSMUST00000183609 215 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm29139-201ENSMUST00000185794 248 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm28822-201ENSMUST00000191140 778 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprkP35822 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprkP35822 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Olfr209-201ENSMUST00000055868 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Ube2nl-201ENSMUST00000085228 456 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Slfn8-201ENSMUST00000038141 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm36944-201ENSMUST00000192257 2759 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprkP35822 1700019E08Rik-202ENSMUST00000153567 635 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm16303-201ENSMUST00000161498 390 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm44475-201ENSMUST00000204041 424 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprkP35822 AC165164.2-201ENSMUST00000220313 392 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Olfr606-201ENSMUST00000098200 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PtprkP35822 A530099J19Rik-201ENSMUST00000151029 2764 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Olfr988-202ENSMUST00000111597 1702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Uqcrh-ps2-201ENSMUST00000121613 269 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PtprkP35822 Gm26027-201ENSMUST00000122725 268 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms