Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
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Vpreb1P13372 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
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Vpreb1P13372 Olfr1318-201ENSMUST00000058176 1690 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Syne2-210ENSMUST00000143031 21704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Pde1a-206ENSMUST00000102655 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Btla-201ENSMUST00000063654 3235 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Olfr801-204ENSMUST00000216067 4014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Zfp850-203ENSMUST00000180502 6163 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Gm38260-201ENSMUST00000193573 3995 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Vmn2r76-201ENSMUST00000165771 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Pign-205ENSMUST00000186485 6759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Olfr1031-202ENSMUST00000216807 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Vmn1r52-207ENSMUST00000228394 3069 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Olfr548-ps1-202ENSMUST00000210064 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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Vpreb1P13372 AL589737.1-201ENSMUST00000221163 2763 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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Vpreb1P13372 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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Vpreb1P13372 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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Vpreb1P13372 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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Vpreb1P13372 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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Vpreb1P13372 Gm42551-201ENSMUST00000197701 1573 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Olfr681-204ENSMUST00000215564 4487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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Vpreb1P13372 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Vmn1r45-205ENSMUST00000227571 2757 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Vmn2r27-201ENSMUST00000100968 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Vmn2r26-201ENSMUST00000032238 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Vmn1r169-204ENSMUST00000227932 2745 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Igkv1-88-201ENSMUST00000103336 362 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Gm6592-201ENSMUST00000115563 507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vpreb1P13372 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms