Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Cfh-202ENSMUST00000111976 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Gm21060J3KMU4 Cfh-201ENSMUST00000066859 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Gm21060J3KMU4 A630033H20Rik-206ENSMUST00000180182 2997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Gm21060J3KMU4 Gm20619-201ENSMUST00000175814 2008 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Gm21060J3KMU4 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm43870-201ENSMUST00000205102 4369 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Olfr1020-202ENSMUST00000215347 2640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm37970-201ENSMUST00000193865 1732 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Olfr679-202ENSMUST00000214328 5184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Igkv1-135-201ENSMUST00000103303 394 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm24281-201ENSMUST00000104234 136 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm25967-201ENSMUST00000157168 147 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm22637-201ENSMUST00000158144 283 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Sult2a4-202ENSMUST00000165167 964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm27976-201ENSMUST00000183635 162 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm29320-201ENSMUST00000185235 615 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm28574-201ENSMUST00000185757 699 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm28781-201ENSMUST00000185760 696 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm28339-201ENSMUST00000185845 696 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm28596-201ENSMUST00000185870 696 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm28471-201ENSMUST00000185994 615 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm29062-201ENSMUST00000186032 694 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm29179-202ENSMUST00000186138 615 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm29574-201ENSMUST00000186226 696 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm28598-201ENSMUST00000186490 615 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm28828-201ENSMUST00000186601 696 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm28057-201ENSMUST00000186603 615 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm29448-201ENSMUST00000186675 615 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm29314-201ENSMUST00000186800 615 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm28255-201ENSMUST00000187101 694 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm29307-201ENSMUST00000187367 696 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm28397-201ENSMUST00000187970 699 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm28253-202ENSMUST00000187971 615 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm28896-201ENSMUST00000188609 696 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm29268-201ENSMUST00000188669 615 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm29545-201ENSMUST00000188878 694 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm29339-201ENSMUST00000189613 696 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm29169-201ENSMUST00000189835 615 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm28159-201ENSMUST00000190296 696 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm29366-201ENSMUST00000190481 699 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm29218-205ENSMUST00000190846 615 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm28978-201ENSMUST00000191120 615 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm29407-201ENSMUST00000191468 696 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm37172-201ENSMUST00000191926 615 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm32295-201ENSMUST00000192558 696 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm37433-201ENSMUST00000192695 678 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm31260-201ENSMUST00000193478 696 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm37670-201ENSMUST00000193622 229 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm37441-201ENSMUST00000194430 678 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm38107-201ENSMUST00000194873 696 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm44294-201ENSMUST00000205090 728 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm45434-201ENSMUST00000210550 293 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 AC166056.1-201ENSMUST00000223139 441 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Snora70-201ENSMUST00000083047 137 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Olfr365-203ENSMUST00000218602 5374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Csnka2ip-202ENSMUST00000209382 2859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Vmn1r51-207ENSMUST00000227766 4218 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Nae1-201ENSMUST00000034349 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Zfp945-205ENSMUST00000160457 6497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Stk31-202ENSMUST00000163954 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Slco6d1-202ENSMUST00000160796 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Lyst-201ENSMUST00000110559 13181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm5248-201ENSMUST00000186108 4046 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Cr2-212ENSMUST00000210219 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Mir761-201ENSMUST00000103245 76 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Zfp931-202ENSMUST00000108924 962 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm14399-203ENSMUST00000109059 703 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm14399-205ENSMUST00000109062 626 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Olfr1171-ps1-201ENSMUST00000118079 837 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm13314-201ENSMUST00000118742 335 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm11982-201ENSMUST00000121480 314 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm15263-201ENSMUST00000121556 642 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm15885-201ENSMUST00000122114 388 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 2210408F21Rik-206ENSMUST00000138653 417 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm21060J3KMU4 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms