Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm1979-202ENSMUST00000170224 666 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm19807-201ENSMUST00000173971 667 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm5876-201ENSMUST00000203735 243 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 4930540M03Rik-201ENSMUST00000216952 437 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Olfr964-ps1-201ENSMUST00000217577 914 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 AC158641.1-201ENSMUST00000218933 229 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 AC119241.1-201ENSMUST00000223651 534 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 AC154241.1-201ENSMUST00000223952 356 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 BC048502-201ENSMUST00000065978 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm23975-201ENSMUST00000082685 106 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Mir346-201ENSMUST00000083547 98 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 n-R5s7-201ENSMUST00000083755 121 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm36962-201ENSMUST00000192114 1761 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Dmd-201ENSMUST00000113991 4438 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm44682-201ENSMUST00000208501 2614 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm3623-201ENSMUST00000173643 2747 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Vmn2r48-201ENSMUST00000165611 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Vmn2r51-201ENSMUST00000094863 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Olfr951-202ENSMUST00000216107 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm43990-201ENSMUST00000203790 1691 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Fat3-205ENSMUST00000217308 18760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 AC153964.1-201ENSMUST00000219677 3142 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Olfr106-ps-202ENSMUST00000214704 1791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps2-201ENSMUST00000118464 834 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Sult1b1-203ENSMUST00000120150 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Klra11-ps-201ENSMUST00000122033 810 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm4725-201ENSMUST00000151048 587 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm15767-202ENSMUST00000153786 544 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm23960-201ENSMUST00000157206 131 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm25427-201ENSMUST00000157605 103 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 H2al2c-201ENSMUST00000163651 336 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 H2al2b-201ENSMUST00000168551 336 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm38069-201ENSMUST00000195360 2144 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm44521-201ENSMUST00000206469 217 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm44852-201ENSMUST00000207950 369 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 AC159231.1-201ENSMUST00000225365 226 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 AC154270.1-201ENSMUST00000227226 426 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Olfr1499-201ENSMUST00000055672 1052 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Olfr482-201ENSMUST00000081184 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Slfn8-201ENSMUST00000038141 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Olfr1123-203ENSMUST00000216208 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm42552-201ENSMUST00000196754 4497 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Naa16-201ENSMUST00000022597 13223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm13100-201ENSMUST00000117157 1439 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm42583-201ENSMUST00000202678 6700 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Nfia-204ENSMUST00000107057 8913 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 4932429P05Rik-201ENSMUST00000113958 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 AC132336.1-201ENSMUST00000222844 1740 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Vmn1r169-204ENSMUST00000227932 2745 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm14879-201ENSMUST00000117308 507 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps132-201ENSMUST00000120434 892 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm13508-201ENSMUST00000121639 775 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm10444-201ENSMUST00000126708 148 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm13905-201ENSMUST00000140009 579 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm21070-201ENSMUST00000182425 985 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm29031-201ENSMUST00000185316 614 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm29000-201ENSMUST00000185444 614 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm28204-201ENSMUST00000185934 614 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm28290-201ENSMUST00000186505 614 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm28161-201ENSMUST00000186669 614 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm28967-201ENSMUST00000187351 281 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 1700121L16Rik-201ENSMUST00000189166 561 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms