Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Olfr629-203ENSMUST00000216300 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Olfr495-202ENSMUST00000215215 2460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm37527-201ENSMUST00000192406 3547 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm11830-201ENSMUST00000120175 561 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 4930522O17Rik-201ENSMUST00000155178 447 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm9722-201ENSMUST00000194568 802 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Olfr1114-ps1-201ENSMUST00000213896 456 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Limd1Q9QXD8 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Vmn2r-ps2-201ENSMUST00000121053 765 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm44348-201ENSMUST00000200165 122 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm26225-201ENSMUST00000082508 135 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms