Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Syf2Q9D198 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Syf2Q9D198 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Syf2Q9D198 Vmn2r-ps75-201ENSMUST00000173251 213 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Syf2Q9D198 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Syf2Q9D198 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Syf2Q9D198 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Syf2Q9D198 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Syf2Q9D198 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Syf2Q9D198 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Syf2Q9D198 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Syf2Q9D198 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Syf2Q9D198 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Syf2Q9D198 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Syf2Q9D198 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Syf2Q9D198 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Syf2Q9D198 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Syf2Q9D198 Gm46138-201ENSMUST00000215294 426 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Syf2Q9D198 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Syf2Q9D198 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Syf2Q9D198 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Syf2Q9D198 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Syf2Q9D198 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Syf2Q9D198 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Syf2Q9D198 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Syf2Q9D198 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Syf2Q9D198 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Syf2Q9D198 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Syf2Q9D198 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Syf2Q9D198 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Olfr91-203ENSMUST00000217372 3809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Pak3-204ENSMUST00000112865 8484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Gm37831-201ENSMUST00000191685 1787 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Olfr951-202ENSMUST00000216107 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Gm26468-201ENSMUST00000158644 106 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Gm20619-204ENSMUST00000181343 786 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Rian-211ENSMUST00000182737 699 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Gm7870-201ENSMUST00000184467 616 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Gm37828-201ENSMUST00000192496 432 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Gm37272-201ENSMUST00000193401 488 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 AC122508.1-201ENSMUST00000218365 233 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Hmcn1-201ENSMUST00000074783 17908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Elavl4-205ENSMUST00000106600 3799 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Syf2Q9D198 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms