Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm12226-201ENSMUST00000144172 876 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Platr32-201ENSMUST00000148597 394 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Mir1946a-201ENSMUST00000158360 134 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm44009-201ENSMUST00000203539 521 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm8035-201ENSMUST00000204625 687 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 4930587E11Rik-202ENSMUST00000204857 807 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 AC125190.2-201ENSMUST00000221160 497 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 AC119573.1-201ENSMUST00000227960 757 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Dynap-201ENSMUST00000025390 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Snord22-201ENSMUST00000083153 126 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Bcl2a1a-201ENSMUST00000098485 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm38010-201ENSMUST00000192592 2784 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Olfr782-202ENSMUST00000213970 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm37887-201ENSMUST00000192752 2716 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Elf1-202ENSMUST00000110835 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm3972-201ENSMUST00000173960 2861 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Olfr215-201ENSMUST00000061723 4112 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Olfr1270-202ENSMUST00000213946 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Olfr437-202ENSMUST00000205175 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Vmn1r77-203ENSMUST00000227320 8308 ntAPPRIS P2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Pds5b-203ENSMUST00000110486 2900 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm23322-201ENSMUST00000104464 167 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm15021-201ENSMUST00000117832 742 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Amd-ps1-201ENSMUST00000120127 994 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm13743-201ENSMUST00000121486 724 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm26187-201ENSMUST00000157693 101 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Slco6d1-202ENSMUST00000160796 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm6650-201ENSMUST00000166710 614 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Cox6b2-206ENSMUST00000182738 423 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm4644-201ENSMUST00000197587 400 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm43645-201ENSMUST00000200129 341 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 CT010511.1-201ENSMUST00000224570 315 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 AL672194.1-201ENSMUST00000224841 603 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 AC160999.1-201ENSMUST00000225675 810 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 AC123858.1-201ENSMUST00000226948 1874 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Hamp-201ENSMUST00000062620 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Vmn1r42-202ENSMUST00000226436 4045 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Olfr642-202ENSMUST00000214299 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 4932429P05Rik-201ENSMUST00000113958 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Olfr1185-ps1-201ENSMUST00000075025 3344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Cp-205ENSMUST00000108329 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Ptprz1-201ENSMUST00000090568 8068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Nlrp2-201ENSMUST00000045022 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm9078-201ENSMUST00000119126 617 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm13459-201ENSMUST00000121558 646 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm15949-201ENSMUST00000129485 126 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm27611-201ENSMUST00000184690 108 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 1700121L16Rik-201ENSMUST00000189166 561 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm18611-201ENSMUST00000200334 1118 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm17780-201ENSMUST00000207142 612 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 AC153382.1-201ENSMUST00000217953 1007 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm46998-201ENSMUST00000221444 330 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 AC154738.5-201ENSMUST00000227397 310 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 2900092C05Rik-201ENSMUST00000032541 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Olfr347-201ENSMUST00000078761 943 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Mir28a-201ENSMUST00000083560 86 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 1700010D01Rik-201ENSMUST00000096366 507 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Zfp616-201ENSMUST00000074813 5014 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm15356-201ENSMUST00000140669 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm44689-201ENSMUST00000208786 1372 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Olfr1143-202ENSMUST00000099852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 AC167420.1-201ENSMUST00000222999 2121 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Vmn1r18-202ENSMUST00000228574 14315 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Btbd35f17-201ENSMUST00000105014 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Olfr919-202ENSMUST00000215612 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Olfr853-202ENSMUST00000213834 3888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Olfr187-202ENSMUST00000207673 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm42447-201ENSMUST00000200102 2903 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Zfp990-201ENSMUST00000105741 3044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm10340-201ENSMUST00000170790 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Mga-204ENSMUST00000110774 13931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm14401-201ENSMUST00000108968 247 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm14926-201ENSMUST00000120650 508 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm7618-201ENSMUST00000121643 171 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.5 ms