Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm43304-201ENSMUST00000196803 326 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Amd-ps5-201ENSMUST00000198406 989 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Gm44389-201ENSMUST00000203795 182 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Gm43897-201ENSMUST00000204019 309 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Gm19761-201ENSMUST00000205372 391 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Olfr723-202ENSMUST00000206058 1078 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Usp49Q6P9L4 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Olfr1073-ps1-202ENSMUST00000215705 478 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 AC154727.1-201ENSMUST00000226537 499 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 AC164437.2-201ENSMUST00000228915 797 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Olfr1487-205ENSMUST00000217061 4080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Usp9x-201ENSMUST00000089302 11887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Vmn2r-ps5-201ENSMUST00000175971 2730 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Olfr1037-202ENSMUST00000213333 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Olfr1197-202ENSMUST00000213118 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Ighv1-4-201ENSMUST00000103493 351 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Gm15553-201ENSMUST00000118757 430 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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Usp49Q6P9L4 Gm14725-201ENSMUST00000120324 828 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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Usp49Q6P9L4 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
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Usp49Q6P9L4 Gm22907-201ENSMUST00000175198 126 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Gm22625-201ENSMUST00000175382 126 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Gm22875-201ENSMUST00000175449 126 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Gm25197-201ENSMUST00000175516 126 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Gm27857-201ENSMUST00000176930 126 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Gm26268-201ENSMUST00000177685 126 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Gm23681-201ENSMUST00000178821 126 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Gm23145-201ENSMUST00000178912 79 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Nutf2-ps2-201ENSMUST00000179225 384 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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Usp49Q6P9L4 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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Usp49Q6P9L4 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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Usp49Q6P9L4 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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Usp49Q6P9L4 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Usp49Q6P9L4 Pign-205ENSMUST00000186485 6759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Usp49Q6P9L4 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Usp49Q6P9L4 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Gm14881-201ENSMUST00000120366 372 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 2610024D14Rik-201ENSMUST00000121233 294 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Gm13335-201ENSMUST00000129994 471 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 R3hcc1l-202ENSMUST00000160107 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usp49Q6P9L4 Gm1979-202ENSMUST00000170224 666 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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