Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Hm629797-201ENSMUST00000183645 2398 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Vmn1r36-203ENSMUST00000226728 1458 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 AL589737.1-201ENSMUST00000221163 2763 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 5330437M03Rik-201ENSMUST00000201318 4083 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Trappc13-205ENSMUST00000144060 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm11718-201ENSMUST00000119942 537 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm17416-201ENSMUST00000163724 201 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Ppp1r2-ps9-201ENSMUST00000173100 549 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Olfr625-ps1-202ENSMUST00000190218 927 ntAPPRIS ALT2 BASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 AC166343.1-201ENSMUST00000213261 577 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Olfr908-201ENSMUST00000215139 932 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Olfr617-201ENSMUST00000048265 957 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Olfr44-201ENSMUST00000077757 1071 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm45176-201ENSMUST00000207696 4096 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm11403-201ENSMUST00000122195 369 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm12226-201ENSMUST00000144172 876 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm37946-201ENSMUST00000192064 347 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm35625-202ENSMUST00000211040 266 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Mir30e-201ENSMUST00000083475 92 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Vmn1r52-207ENSMUST00000228394 3069 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Olfr699-202ENSMUST00000215952 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm5447-201ENSMUST00000070258 1773 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Vmn1r89-208ENSMUST00000228587 2061 ntAPPRIS P2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 B3galt1-201ENSMUST00000042456 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Tfpi-205ENSMUST00000111717 2962 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Apool-202ENSMUST00000113415 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm11281-201ENSMUST00000141391 576 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm22135-201ENSMUST00000158752 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm43475-201ENSMUST00000196673 400 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm14325-201ENSMUST00000108939 1576 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 AC153964.1-201ENSMUST00000219677 3142 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm37006-201ENSMUST00000195253 2674 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Olfr301-201ENSMUST00000174362 1937 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Has2-201ENSMUST00000050544 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 AC153150.1-201ENSMUST00000226065 3782 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Vmn2r30-202ENSMUST00000174368 3688 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 A630033H20Rik-206ENSMUST00000180182 2997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm15060-201ENSMUST00000119550 948 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 4930513N10Rik-202ENSMUST00000132616 490 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm37814-201ENSMUST00000195820 3644 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Eda2r-201ENSMUST00000037353 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Zfp300-201ENSMUST00000040667 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Ddx60-201ENSMUST00000070631 6535 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm37211-201ENSMUST00000193392 3433 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Olfr536-205ENSMUST00000215768 4231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm13677-201ENSMUST00000120739 595 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm20399-201ENSMUST00000174652 132 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm26988-201ENSMUST00000183296 945 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NipblQ6KCD5 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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