Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Cyp3a44-201ENSMUST00000067479 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Olfr1458-202ENSMUST00000215160 1914 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Rnf40Q3U319 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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Rnf40Q3U319 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Rnf40Q3U319 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Rnf40Q3U319 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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Rnf40Q3U319 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Nae1-201ENSMUST00000034349 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm24715-201ENSMUST00000102377 95 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm23424-201ENSMUST00000103889 110 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm12724-201ENSMUST00000140196 665 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm38150-201ENSMUST00000192996 452 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf40Q3U319 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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