Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Pls3-203ENSMUST00000114058 3032 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm7709-201ENSMUST00000199391 1858 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm15428-201ENSMUST00000121352 333 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Rgs2-204ENSMUST00000153527 588 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm22631-201ENSMUST00000179656 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm25471-201ENSMUST00000180126 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms