Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp2Q06649 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp2Q06649 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp2Q06649 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp2Q06649 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp2Q06649 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp2Q06649 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp2Q06649 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp2Q06649 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp2Q06649 Gm25699-201ENSMUST00000082896 167 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp2Q06649 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp2Q06649 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp2Q06649 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp2Q06649 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp2Q06649 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp2Q06649 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp2Q06649 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp2Q06649 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp2Q06649 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp2Q06649 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp2Q06649 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sh3bp2Q06649 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp2Q06649 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp2Q06649 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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Sh3bp2Q06649 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp2Q06649 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
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Sh3bp2Q06649 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp2Q06649 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp2Q06649 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
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Sh3bp2Q06649 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sh3bp2Q06649 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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Sh3bp2Q06649 Gm34068-201ENSMUST00000193310 632 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
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Sh3bp2Q06649 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Sh3bp2Q06649 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp2Q06649 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp2Q06649 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp2Q06649 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sh3bp2Q06649 Gm27165-201ENSMUST00000183951 232 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms