Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Gm15075-201ENSMUST00000122187 477 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Gm3025-201ENSMUST00000163454 489 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Serpina3l-ps-201ENSMUST00000163975 1264 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Gm2878-201ENSMUST00000170173 486 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Vmn1r173-201ENSMUST00000174055 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Fam107b-206ENSMUST00000176254 300 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Mir6414-201ENSMUST00000183685 82 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Gm29387-201ENSMUST00000189074 623 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Gm29334-201ENSMUST00000190334 357 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Gm38201-201ENSMUST00000192143 387 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 AL772397.1-201ENSMUST00000216707 606 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Olfr1176-201ENSMUST00000057439 949 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 BC023105-201ENSMUST00000073997 1227 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Gm26072-201ENSMUST00000083135 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Olfr715b-202ENSMUST00000215713 3879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Gm37789-201ENSMUST00000192862 2889 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Olfr905-202ENSMUST00000214377 4429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Mmrn1-201ENSMUST00000129603 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Vmn1r71-205ENSMUST00000227940 4725 ntAPPRIS P2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Olfr145-202ENSMUST00000213688 6691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 A830011K09Rik-202ENSMUST00000162868 2201 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Hfm1-202ENSMUST00000117588 4870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 AC154313.1-201ENSMUST00000217755 3841 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Klrc2-203ENSMUST00000118401 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Gm12577-201ENSMUST00000119701 574 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Zfp984-202ENSMUST00000122309 2405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Gm11506-201ENSMUST00000122414 470 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Gm16563-201ENSMUST00000162673 423 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Vmn2r-ps36-201ENSMUST00000172589 2562 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Gm25999-201ENSMUST00000175398 133 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Mir6960-201ENSMUST00000183449 61 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 AC132384.13-201ENSMUST00000219556 1159 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 CT009754.1-201ENSMUST00000223489 558 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 AC129219.3-201ENSMUST00000223790 196 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 AC122448.1-201ENSMUST00000226317 772 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 CT025536.1-201ENSMUST00000226744 844 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Cdh12-203ENSMUST00000227496 6004 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Mmp1b-201ENSMUST00000047888 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Olfr943-201ENSMUST00000071617 1079 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Olfr924-201ENSMUST00000072977 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Mir30e-201ENSMUST00000083475 92 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Olfr477-201ENSMUST00000091605 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Pkp1P97350 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 AC154329.1-201ENSMUST00000224408 3129 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm43751-201ENSMUST00000200275 3071 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm42447-201ENSMUST00000200102 2903 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Mir551b-201ENSMUST00000102165 98 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm13567-201ENSMUST00000118026 247 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm15377-201ENSMUST00000119594 246 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm15364-201ENSMUST00000119618 585 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Vmn2r-ps122-201ENSMUST00000176687 906 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm11394-201ENSMUST00000181421 517 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm28615-201ENSMUST00000187527 482 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 B230334C09Rik-201ENSMUST00000200255 8927 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Klk1b18-ps-201ENSMUST00000205780 167 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm9655-201ENSMUST00000211321 1284 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 AC166343.1-201ENSMUST00000213261 577 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm23443-201ENSMUST00000082916 128 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Pkp1P97350 Cp-205ENSMUST00000108329 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms