Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 AC155237.2-201ENSMUST00000228487 478 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VdrP48281 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
VdrP48281 Vmn1r211-201ENSMUST00000073728 985 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
VdrP48281 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VdrP48281 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
VdrP48281 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
VdrP48281 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
VdrP48281 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
VdrP48281 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
VdrP48281 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
VdrP48281 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
VdrP48281 Olfr1368-202ENSMUST00000216039 1389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
VdrP48281 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
VdrP48281 Olfr1130-201ENSMUST00000213103 2643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
VdrP48281 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Olfr1318-205ENSMUST00000217533 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm23743-201ENSMUST00000157389 274 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 9430078K24Rik-202ENSMUST00000219857 348 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Olfr1095-201ENSMUST00000099874 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VdrP48281 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
VdrP48281 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
VdrP48281 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
VdrP48281 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
VdrP48281 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
VdrP48281 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm43185-201ENSMUST00000197507 2775 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Ifi208-201ENSMUST00000085876 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 S100a5-202ENSMUST00000107329 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm2389-201ENSMUST00000160487 189 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VdrP48281 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms