Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm24235-201ENSMUST00000104319 129 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm11352-201ENSMUST00000119264 517 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm6486-201ENSMUST00000166202 434 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Zfp456-202ENSMUST00000172266 679 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 AC161520.1-201ENSMUST00000210954 939 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Olfr677-201ENSMUST00000098161 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Olfr1171-ps1-201ENSMUST00000118079 837 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm11623-201ENSMUST00000120176 1225 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Mir7056-201ENSMUST00000183776 59 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm28596-201ENSMUST00000185870 696 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm32295-201ENSMUST00000192558 696 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm31260-201ENSMUST00000193478 696 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Serpinb10-203ENSMUST00000194951 1194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm8953-201ENSMUST00000198497 904 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 AC153382.1-201ENSMUST00000217953 1007 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gli1P47806 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms