Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm35070-201ENSMUST00000192589 621 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm30686-202ENSMUST00000195371 621 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm36520-201ENSMUST00000200449 400 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 AC152062.1-201ENSMUST00000218129 386 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Olfr715b-201ENSMUST00000081044 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Vmn1r14-203ENSMUST00000227574 7394 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm42876-201ENSMUST00000196989 3215 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm32061-201ENSMUST00000207232 3478 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 AC151831.1-201ENSMUST00000227609 4033 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Olfr1016-203ENSMUST00000217410 2738 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm28362-201ENSMUST00000189430 2420 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RxraP28700 Rps6ka3-204ENSMUST00000112493 3671 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 Olfr669-202ENSMUST00000210138 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 Mir208b-201ENSMUST00000104735 77 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 Rap1gapos-201ENSMUST00000135358 471 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 Has2os-203ENSMUST00000165880 638 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm28596-201ENSMUST00000185870 696 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm29130-201ENSMUST00000191015 618 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm32295-201ENSMUST00000192558 696 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm31260-201ENSMUST00000193478 696 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm38008-201ENSMUST00000195333 518 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 Fxyd1-210ENSMUST00000206012 501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 1700054O05Rik-201ENSMUST00000214107 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 AC117202.1-201ENSMUST00000227007 445 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 Olfr427-201ENSMUST00000080831 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 n-R5s152-201ENSMUST00000093641 119 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm43990-201ENSMUST00000203790 1691 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm26853-201ENSMUST00000180757 4010 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Olfr414-202ENSMUST00000192358 4526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Rpl23a-ps14-201ENSMUST00000118777 424 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm12691-201ENSMUST00000120186 456 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm25106-201ENSMUST00000122672 134 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm12909-201ENSMUST00000134190 620 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 1700123O12Rik-203ENSMUST00000145856 425 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RxraP28700 Gm22383-201ENSMUST00000158188 327 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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