Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PrkcaP20444 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PrkcaP20444 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm25213-201ENSMUST00000102388 113 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm9078-201ENSMUST00000119126 617 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm14362-201ENSMUST00000121679 273 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm12909-201ENSMUST00000134190 620 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm15254-201ENSMUST00000149567 273 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm25334-201ENSMUST00000158036 110 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 1700113H08Rik-203ENSMUST00000189775 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 CT030184.1-201ENSMUST00000222393 416 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Vmn1r184-204ENSMUST00000227534 4807 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm17308-201ENSMUST00000181749 1997 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm4758-201ENSMUST00000114851 291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Olfr1171-ps1-201ENSMUST00000118079 837 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PrkcaP20444 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms