Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Ddx60-202ENSMUST00000093485 5989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Gm22380-201ENSMUST00000157479 95 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Gm24014-201ENSMUST00000157728 157 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Gm17781-201ENSMUST00000195232 649 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Gm4644-201ENSMUST00000197587 400 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 AC132465.3-201ENSMUST00000219326 195 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Gm40658-203ENSMUST00000222210 1070 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 AC166358.4-201ENSMUST00000223030 105 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Txndc9-204ENSMUST00000193832 3472 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Vmn1r66-205ENSMUST00000228622 3304 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Gm37747-201ENSMUST00000193717 4003 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Olfr1404-203ENSMUST00000217374 3686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Gm38240-201ENSMUST00000195110 2487 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Gm13762-201ENSMUST00000144908 2612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Olfr638-201ENSMUST00000209757 966 ntAPPRIS P2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 2500002B13Rik-202ENSMUST00000210752 298 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Olfr516-203ENSMUST00000217279 1441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 AC154313.1-201ENSMUST00000217755 3841 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Gm38010-201ENSMUST00000192592 2784 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Zfp980-201ENSMUST00000105738 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Olfr235-205ENSMUST00000214638 3459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Cdh7-201ENSMUST00000027542 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 A630033H20Rik-206ENSMUST00000180182 2997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 2310001H17Rik-201ENSMUST00000180379 521 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Ptma-ps1-201ENSMUST00000181079 309 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 4933440J02Rik-201ENSMUST00000181547 1144 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Znrd1as-204ENSMUST00000209623 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Ccr2-201ENSMUST00000055918 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Gm45321-201ENSMUST00000209286 2863 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Gm42447-201ENSMUST00000200102 2903 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Vmn1r174-202ENSMUST00000228331 9058 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
PtprbB2RU80 Spata31d1c-201ENSMUST00000099427 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PtprbB2RU80 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PtprbB2RU80 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PtprbB2RU80 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PtprbB2RU80 Gm43010-201ENSMUST00000195993 2878 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PtprbB2RU80 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PtprbB2RU80 Gm38073-201ENSMUST00000195141 3665 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PtprbB2RU80 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PtprbB2RU80 Gm11645-201ENSMUST00000121589 649 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PtprbB2RU80 Gm15949-201ENSMUST00000129485 126 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PtprbB2RU80 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PtprbB2RU80 H2al1k-201ENSMUST00000178196 510 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PtprbB2RU80 Gm28614-201ENSMUST00000186483 458 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PtprbB2RU80 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PtprbB2RU80 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PtprbB2RU80 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PtprbB2RU80 Gm28044-201ENSMUST00000044819 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PtprbB2RU80 Mir30e-201ENSMUST00000083475 92 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PtprbB2RU80 Olfr418-202ENSMUST00000213420 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PtprbB2RU80 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PtprbB2RU80 Vmn2r-ps40-201ENSMUST00000174438 2558 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PtprbB2RU80 Gm45304-201ENSMUST00000210303 2828 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PtprbB2RU80 Olfr699-203ENSMUST00000216307 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PtprbB2RU80 Gm37412-201ENSMUST00000194866 4321 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PtprbB2RU80 Gm14636-202ENSMUST00000150801 5060 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PtprbB2RU80 Olfr639-202ENSMUST00000215653 6570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms