Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Scgb2b16-ps-201ENSMUST00000188720 333 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm17777-201ENSMUST00000189740 1276 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm37272-201ENSMUST00000193401 488 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Olfr1369-ps1-201ENSMUST00000079050 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Olfr536-205ENSMUST00000215768 4231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Olfr720-203ENSMUST00000216079 4692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm43092-201ENSMUST00000202986 1854 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Olfr876-203ENSMUST00000215287 4474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 AC135119.1-201ENSMUST00000227935 3717 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm12010-201ENSMUST00000122400 2017 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 A230085B16Rik-201ENSMUST00000209781 1856 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Vwa5a-201ENSMUST00000001544 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm20773-201ENSMUST00000178940 681 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Rp31-ps19-201ENSMUST00000180929 353 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm43601-201ENSMUST00000196294 945 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 AC123064.1-201ENSMUST00000218950 406 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm9628-201ENSMUST00000222169 725 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Olfr1249-201ENSMUST00000099769 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm3623-201ENSMUST00000173643 2747 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm42946-201ENSMUST00000196108 2570 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Prrt4B2RU40 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Prrt4B2RU40 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Prrt4B2RU40 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Prrt4B2RU40 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Prrt4B2RU40 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Prrt4B2RU40 Gm8675-201ENSMUST00000201408 1856 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Prrt4B2RU40 AC144772.3-201ENSMUST00000228829 3126 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Prrt4B2RU40 Gm36927-201ENSMUST00000192504 1841 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Prrt4B2RU40 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Prrt4B2RU40 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Prrt4B2RU40 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Prrt4B2RU40 Gm14444-201ENSMUST00000109069 919 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Prrt4B2RU40 Gm9078-201ENSMUST00000119126 617 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Prrt4B2RU40 Gm5943-201ENSMUST00000119458 459 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Prrt4B2RU40 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Prrt4B2RU40 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Prrt4B2RU40 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms