Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm23743-201ENSMUST00000157389 274 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm22789-201ENSMUST00000157884 130 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm9376-201ENSMUST00000171107 729 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps145-201ENSMUST00000175863 424 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm28889-201ENSMUST00000185350 959 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm17811-201ENSMUST00000206193 387 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm19366-201ENSMUST00000206996 156 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm45458-201ENSMUST00000209900 522 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Olfr1119-ps1-201ENSMUST00000215282 634 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 AC154635.1-201ENSMUST00000221433 400 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm30409-201ENSMUST00000223302 229 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Zfp667-202ENSMUST00000108562 3498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Fzd3-202ENSMUST00000131309 12734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 AC158605.2-201ENSMUST00000220287 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm45211-201ENSMUST00000206208 2650 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Zfp990-201ENSMUST00000105741 3044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Klhl15-204ENSMUST00000113915 6241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Hm629797-201ENSMUST00000183645 2398 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm42616-201ENSMUST00000198989 4184 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm24608-201ENSMUST00000104381 136 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Fbxo48-202ENSMUST00000109635 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm24840-201ENSMUST00000122603 147 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm23905-201ENSMUST00000157568 109 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm22211-201ENSMUST00000158097 156 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm24224-201ENSMUST00000158828 258 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm17061-201ENSMUST00000163167 499 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm27896-201ENSMUST00000175162 317 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm6214-201ENSMUST00000178845 541 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm29479-201ENSMUST00000190352 455 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm8209-201ENSMUST00000206386 553 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Olfr310-202ENSMUST00000217724 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 AC159472.1-201ENSMUST00000218178 463 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 CT030170.6-201ENSMUST00000221149 550 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm18338-201ENSMUST00000222381 560 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 AC166056.1-201ENSMUST00000223139 441 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 CT030705.1-201ENSMUST00000223971 533 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 AC099612.2-201ENSMUST00000226824 721 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 AC137961.1-201ENSMUST00000227924 734 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Fabp9-201ENSMUST00000029038 583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Tas2r136-201ENSMUST00000065532 984 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm6369-201ENSMUST00000069626 412 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Olfr1507-201ENSMUST00000073571 1112 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 n-R5s86-201ENSMUST00000083215 119 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Mir215-201ENSMUST00000083628 112 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Cftr-201ENSMUST00000045706 6303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Zfp131-201ENSMUST00000177916 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Olfr1197-202ENSMUST00000213118 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 AC144772.3-201ENSMUST00000228829 3126 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Tnfrsf26-202ENSMUST00000208124 3062 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Cntn6-201ENSMUST00000089215 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Cdh12-203ENSMUST00000227496 6004 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Igkv1-88-201ENSMUST00000103336 362 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm15001-201ENSMUST00000117657 795 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm11698-201ENSMUST00000117948 455 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm12889-201ENSMUST00000118684 241 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Defa-ps1-201ENSMUST00000119062 282 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm9308-201ENSMUST00000119073 448 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm11861-201ENSMUST00000141571 382 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm23496-201ENSMUST00000157741 248 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm22637-201ENSMUST00000158144 283 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Grik3B1AS29 Gm16134-201ENSMUST00000161714 336 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms