Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm29634-201ENSMUST00000188467 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm28699-201ENSMUST00000189193 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm43601-201ENSMUST00000196294 945 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 AC160863.2-201ENSMUST00000218392 858 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Olfr611-201ENSMUST00000078108 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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Hdac6Q9Z2V5 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
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Hdac6Q9Z2V5 Gm12691-201ENSMUST00000120186 456 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
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Hdac6Q9Z2V5 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
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Hdac6Q9Z2V5 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 2810025M15Rik-203ENSMUST00000189791 251 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
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Hdac6Q9Z2V5 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm8319-201ENSMUST00000205708 641 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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Hdac6Q9Z2V5 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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Hdac6Q9Z2V5 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm6757-201ENSMUST00000189810 1706 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
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Hdac6Q9Z2V5 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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