Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm29793-201ENSMUST00000202874 460 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AL669916.5-201ENSMUST00000214874 361 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Mir19a-201ENSMUST00000083482 82 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Olfr1095-201ENSMUST00000099874 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Iglv3-201ENSMUST00000103751 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm24608-201ENSMUST00000104381 136 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm12596-201ENSMUST00000124589 673 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm25520-201ENSMUST00000158389 118 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm16290-201ENSMUST00000161175 474 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm21834-201ENSMUST00000178907 453 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm17781-201ENSMUST00000195232 649 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Mir6375-201ENSMUST00000197176 95 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm18120-201ENSMUST00000220079 511 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC091783.4-201ENSMUST00000224940 611 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm23455-201ENSMUST00000083331 100 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm3867-201ENSMUST00000086108 279 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Olfr19-202ENSMUST00000206365 1967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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