Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Gm43036-201ENSMUST00000200594 373 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm44054-201ENSMUST00000203814 372 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm18320-201ENSMUST00000211304 595 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 AC153382.1-201ENSMUST00000217953 1007 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 AC154467.1-201ENSMUST00000227527 449 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 BC048502-201ENSMUST00000065978 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm37143-201ENSMUST00000195180 3259 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm5591-201ENSMUST00000079759 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Ak9-201ENSMUST00000173494 6968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm26075-201ENSMUST00000104062 121 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Znrd1-201ENSMUST00000113669 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm23318-201ENSMUST00000158000 108 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm11983-202ENSMUST00000184940 318 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm36382-201ENSMUST00000198892 541 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm44261-201ENSMUST00000203337 209 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm31717-201ENSMUST00000213044 668 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 AC127581.1-201ENSMUST00000214084 771 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 4930563J15Rik-203ENSMUST00000219796 574 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Sult6b1-204ENSMUST00000169544 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Olfr32-204ENSMUST00000215153 3117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Prune2-201ENSMUST00000087689 12512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Pde1a-204ENSMUST00000102653 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 AC165106.3-201ENSMUST00000228191 3843 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Olfr884-202ENSMUST00000181088 3185 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Nfia-205ENSMUST00000107062 9239 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm12708-201ENSMUST00000126143 349 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm12724-201ENSMUST00000140196 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm25981-201ENSMUST00000157921 295 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm8790-201ENSMUST00000194108 322 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm44354-201ENSMUST00000196017 143 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm4859-201ENSMUST00000199625 787 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm42666-201ENSMUST00000201954 152 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm17737-201ENSMUST00000210183 1147 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm22155-201ENSMUST00000083836 162 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm10256-201ENSMUST00000179404 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 AC154681.1-201ENSMUST00000225876 1735 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Olfr753-ps1-204ENSMUST00000219487 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ddx20Q9JJY4 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms