Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm36548-201ENSMUST00000197473 685 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Olfr484-201ENSMUST00000210881 1098 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 AC161256.1-201ENSMUST00000217312 213 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Ssxb3-202ENSMUST00000089379 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm11631-201ENSMUST00000119220 156 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm7485-201ENSMUST00000119502 1109 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm15946-201ENSMUST00000160654 423 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Ranbp2-ps4-201ENSMUST00000183481 385 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Mir6971-201ENSMUST00000183497 63 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Ms4a4a-201ENSMUST00000188995 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Ube2l3-ps1-201ENSMUST00000199777 436 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm34838-201ENSMUST00000209231 958 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 AU023762-202ENSMUST00000209716 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm32975-201ENSMUST00000211651 584 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 AC156639.1-201ENSMUST00000216503 660 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Olfr695-201ENSMUST00000216868 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 AC157494.1-201ENSMUST00000221127 549 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Olfr918-201ENSMUST00000055099 978 ntAPPRIS P2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Olfr273-202ENSMUST00000107670 4796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Olfr1298-202ENSMUST00000208284 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rnft1Q9DCN7 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms