Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13720-201ENSMUST00000120741 196 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27477-201ENSMUST00000184649 143 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28471-201ENSMUST00000185994 615 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28598-201ENSMUST00000186490 615 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29268-201ENSMUST00000188669 615 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29218-205ENSMUST00000190846 615 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28978-201ENSMUST00000191120 615 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37172-201ENSMUST00000191926 615 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18194-201ENSMUST00000210455 481 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm46194-201ENSMUST00000218136 320 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Rab30-201ENSMUST00000032879 9456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28465-202ENSMUST00000220779 1701 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 A530053G22Rik-201ENSMUST00000060147 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 AC167420.1-201ENSMUST00000222999 2121 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn2r91-201ENSMUST00000172359 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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Gtf3c6Q9D8P7 Klrc2-203ENSMUST00000118401 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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Gtf3c6Q9D8P7 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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Gtf3c6Q9D8P7 Mir3473f-201ENSMUST00000183743 136 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38061-201ENSMUST00000192490 365 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19131-201ENSMUST00000203408 789 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44990-201ENSMUST00000203922 217 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18120-201ENSMUST00000220079 511 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1454-201ENSMUST00000073732 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms