Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Gm19074-201ENSMUST00000218915 1429 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Gm29112-201ENSMUST00000188962 3487 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
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Ddb2Q99J79 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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Ddb2Q99J79 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
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Ddb2Q99J79 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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Ddb2Q99J79 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
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Ddb2Q99J79 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
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Ddb2Q99J79 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
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Ddb2Q99J79 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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Ddb2Q99J79 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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Ddb2Q99J79 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ddb2Q99J79 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms