Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm36962-201ENSMUST00000192114 1761 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm40038-201ENSMUST00000197878 1370 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm2987-201ENSMUST00000187673 1693 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Cp-203ENSMUST00000108325 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Clec1b-203ENSMUST00000112081 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm15094-201ENSMUST00000118394 1131 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm5258-201ENSMUST00000165437 327 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Vmn2r-ps68-201ENSMUST00000173880 861 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm6214-201ENSMUST00000178845 541 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Mir7j-201ENSMUST00000184427 122 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm7967-203ENSMUST00000191409 1049 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm3933-201ENSMUST00000195391 439 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm17956-201ENSMUST00000199931 838 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm45392-201ENSMUST00000210441 214 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm18442-201ENSMUST00000220925 639 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Olfr187-202ENSMUST00000207673 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 B130011K05Rik-201ENSMUST00000151765 3270 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Vmn1r49-202ENSMUST00000203791 1356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Olfr235-204ENSMUST00000214613 2217 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Vmn2r77-201ENSMUST00000164996 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm37397-201ENSMUST00000194579 2842 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Igkv12-98-201ENSMUST00000103327 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm23608-201ENSMUST00000104545 128 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Sult2a1-201ENSMUST00000108522 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm15752-201ENSMUST00000117427 394 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm14878-201ENSMUST00000118167 293 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm7485-201ENSMUST00000119502 1109 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm15796-201ENSMUST00000162135 204 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Olfr325-201ENSMUST00000169428 1065 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm28997-201ENSMUST00000188759 429 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm37272-201ENSMUST00000193401 488 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm38221-201ENSMUST00000195146 365 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm17915-201ENSMUST00000222077 548 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 AC165146.1-201ENSMUST00000223777 900 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Olfr731-201ENSMUST00000059565 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Olfr798-201ENSMUST00000079810 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Vmn2r17-201ENSMUST00000171841 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Elavl4-204ENSMUST00000106598 3997 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Gm45644-201ENSMUST00000210255 2740 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Ptprd-203ENSMUST00000098005 4542 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Apobec3Q99J72 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms