Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm22111-201ENSMUST00000178010 79 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm23687-201ENSMUST00000178664 79 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm24566-201ENSMUST00000179286 79 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm23305-201ENSMUST00000179342 79 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm26389-201ENSMUST00000179819 79 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm22130-201ENSMUST00000179979 79 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm22393-201ENSMUST00000180153 79 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm25085-201ENSMUST00000180298 79 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm27864-201ENSMUST00000183704 190 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Mir7074-201ENSMUST00000183884 63 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Olfr528-ps1-201ENSMUST00000211655 728 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 AC152062.1-201ENSMUST00000218129 386 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Olfr1058-202ENSMUST00000213998 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Olfr301-201ENSMUST00000174362 1937 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Btbd35f12-201ENSMUST00000178827 1908 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Olfr986-202ENSMUST00000214763 3274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Olfr733-203ENSMUST00000214756 3640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm4736-201ENSMUST00000100870 380 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Mir551b-201ENSMUST00000102165 98 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm23481-201ENSMUST00000104173 131 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm11965-201ENSMUST00000122017 277 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm23905-201ENSMUST00000157568 109 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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Atg4aQ8C9S8 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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Atg4aQ8C9S8 Gm45507-201ENSMUST00000210611 519 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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Atg4aQ8C9S8 Gm25200-201ENSMUST00000083094 130 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Olfr338-202ENSMUST00000091006 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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Atg4aQ8C9S8 Olfr898-202ENSMUST00000216304 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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Atg4aQ8C9S8 Olfr665-203ENSMUST00000216257 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm43870-201ENSMUST00000205102 4369 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm13630-201ENSMUST00000127849 3650 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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Atg4aQ8C9S8 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Zfp965-201ENSMUST00000109002 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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Atg4aQ8C9S8 Gm15994-201ENSMUST00000118029 402 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm13359-201ENSMUST00000119000 695 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm14282-201ENSMUST00000119484 240 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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Atg4aQ8C9S8 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Cox6b2-206ENSMUST00000182738 423 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm27828-201ENSMUST00000184108 119 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm38334-201ENSMUST00000195060 313 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 AC126253.2-201ENSMUST00000226518 205 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Atg4aQ8C9S8 Olfr847-201ENSMUST00000079620 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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