Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 AC117202.1-201ENSMUST00000227007 445 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm25404-201ENSMUST00000082970 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Dst-202ENSMUST00000097786 17212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 4930528J11Rik-201ENSMUST00000201689 3611 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm43913-201ENSMUST00000203924 3029 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Cdr1-201ENSMUST00000166381 2313 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Olfr824-202ENSMUST00000214192 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Igkv4-70-201ENSMUST00000103348 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm10964-201ENSMUST00000106852 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Vmn1r-ps108-201ENSMUST00000117059 365 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm12448-201ENSMUST00000118852 655 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm12044-201ENSMUST00000120335 213 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 n-R5s45-201ENSMUST00000122592 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm23496-201ENSMUST00000157741 248 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm27254-201ENSMUST00000183926 517 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm28889-201ENSMUST00000185350 959 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm28997-201ENSMUST00000188759 429 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm29000-207ENSMUST00000190152 1160 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm3933-201ENSMUST00000195391 439 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm43449-201ENSMUST00000202955 371 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm24921-201ENSMUST00000083024 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Olfr477-201ENSMUST00000091605 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Skint3-201ENSMUST00000038455 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Rgs5-201ENSMUST00000027997 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm773-201ENSMUST00000101561 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Mbd3l1-202ENSMUST00000213625 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 AC154374.1-201ENSMUST00000215351 351 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtifQ6PEE2 Olfr1052-201ENSMUST00000054746 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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