Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 1700109I08Rik-201ENSMUST00000185680 396 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 1700027A15Rik-202ENSMUST00000188349 617 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Mir142-201ENSMUST00000198092 64 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Gm31831-202ENSMUST00000198581 278 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Gm44773-201ENSMUST00000207374 557 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Gm44946-201ENSMUST00000208425 572 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 2500002B13Rik-202ENSMUST00000210752 298 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Gm18891-201ENSMUST00000216734 1087 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 9430025C20Rik-201ENSMUST00000068663 2115 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Cnot6l-202ENSMUST00000113005 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Olfr665-202ENSMUST00000215761 2522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Adam26a-201ENSMUST00000049577 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Olfr1016-202ENSMUST00000216425 2698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Hsfy2-201ENSMUST00000062085 1392 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Btbd35f23-201ENSMUST00000189190 1943 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Olfr1249-202ENSMUST00000216124 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Syne2-210ENSMUST00000143031 21704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Gm4788-203ENSMUST00000111989 3187 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Gm26367-201ENSMUST00000104165 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Gm24788-201ENSMUST00000104283 156 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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Ss18Q62280 Vmn1r63-201ENSMUST00000075085 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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Ss18Q62280 Serpina6-201ENSMUST00000044159 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 BC002059-202ENSMUST00000190415 1964 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Gm5798-201ENSMUST00000164613 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Olfr741-203ENSMUST00000213903 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Olfr769-203ENSMUST00000216906 4325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Gm3636-202ENSMUST00000163850 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Mecom-203ENSMUST00000108271 3851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 0610010F05Rik-201ENSMUST00000043356 4392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Dnah7b-201ENSMUST00000069293 12314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Fbxw14-201ENSMUST00000112041 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Gm37045-201ENSMUST00000192016 2463 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Muc15-202ENSMUST00000111016 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Gm10340-201ENSMUST00000170790 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Gm15356-201ENSMUST00000140669 2741 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Gm14885-201ENSMUST00000117969 496 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ss18Q62280 Gm12852-201ENSMUST00000119478 719 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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