Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm22219-201ENSMUST00000157562 319 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm25606-201ENSMUST00000158363 95 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm13144-201ENSMUST00000179385 345 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm27883-201ENSMUST00000183941 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm27828-201ENSMUST00000184108 119 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm27387-201ENSMUST00000184583 116 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm28030-201ENSMUST00000184987 138 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm43814-201ENSMUST00000197851 413 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 AC153977.1-201ENSMUST00000219416 506 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm19134-201ENSMUST00000221203 487 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 CT485608.1-201ENSMUST00000228759 389 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Olfr744-201ENSMUST00000066457 1105 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 BC023105-201ENSMUST00000073997 1227 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Mir30e-201ENSMUST00000083475 92 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 9330159F19Rik-201ENSMUST00000092627 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Olfr741-203ENSMUST00000213903 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Dst-211ENSMUST00000183034 23201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Olfr681-205ENSMUST00000216247 4729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm43178-201ENSMUST00000197257 1386 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm15195-201ENSMUST00000118775 263 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm26476-201ENSMUST00000122618 313 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm12122-201ENSMUST00000124503 454 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm23743-201ENSMUST00000157389 274 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r2-ps9-201ENSMUST00000173100 549 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm22177-201ENSMUST00000175002 158 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm29633-204ENSMUST00000187737 675 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm29387-201ENSMUST00000189074 623 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm8158-201ENSMUST00000219220 465 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm8112-201ENSMUST00000219637 465 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 AC168059.1-201ENSMUST00000225846 841 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 AC154738.1-201ENSMUST00000227054 368 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Zfp711-201ENSMUST00000071814 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1465-201ENSMUST00000080142 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm23518-201ENSMUST00000082835 153 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm23677-201ENSMUST00000083156 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm6902-202ENSMUST00000191169 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm6176-202ENSMUST00000207633 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm38260-201ENSMUST00000193573 3995 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm42547-201ENSMUST00000201159 3798 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Lyst-201ENSMUST00000110559 13181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm11692-201ENSMUST00000122121 902 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm12885-201ENSMUST00000122246 328 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm22453-201ENSMUST00000122801 318 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm15591-201ENSMUST00000138539 627 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Mir6391-201ENSMUST00000184391 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 1700025M24Rik-203ENSMUST00000191524 725 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm32780-201ENSMUST00000201402 540 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Olfr474-201ENSMUST00000054434 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Krtap31-2-201ENSMUST00000058761 935 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Art2b-201ENSMUST00000063920 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Sft2d1Q5SSN7 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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