Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm15026-201ENSMUST00000119219 458 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm15843-201ENSMUST00000146593 529 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm8807-201ENSMUST00000179328 492 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm7128-201ENSMUST00000211639 533 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 AC147615.2-201ENSMUST00000219876 2154 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Sult2a8-201ENSMUST00000063509 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Rnf40Q3U319 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Rnf40Q3U319 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Rnf40Q3U319 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Rnf40Q3U319 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Rnf40Q3U319 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Rnf40Q3U319 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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Rnf40Q3U319 Gm35548-201ENSMUST00000214348 441 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Olfr786-201ENSMUST00000076508 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm25812-201ENSMUST00000082751 103 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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